根管治疗一般可分为三个步骤完成，特殊情况下可1~2次或4~5次完成。我们在这里按3次介绍。
第一次
首先要确诊病人的牙齿是什么病，是否需要根管治疗，同时需要拍第1张X光片。这张片子一方面可起到辅助检查和诊断的作用，另一方面要对根管的数目、根管的通畅度和弯曲度、根分叉和根尖周围炎症的破坏程度以及牙周情况有个明确了解，以评估患牙能否根管治疗、根管治疗的难易度、以及根管治疗的手术能否成功。
另外，还要对牙神经的死活做一个判断，以此来考虑手术时是否需要打麻药。（打麻药前要仔细询问病人是否有麻药过敏史，是否有严重的心脑血管病，并做好应急准备）。如果牙神经是死的，可不打麻药，如果牙神经是活的，则必须打麻药。有时为了消除病人怕痛的恐惧感，有的医生不管牙神经是否死活，手术前打一针麻药给予病人以心理安慰。需要提醒的是，长期酗酒、吸毒、在与麻醉药品长期接触的环境中工作等病人，其麻醉效果较差。
对牙神经是活的牙，麻醉下钻开洞，封上烂神经的药，嘱病人暂时不要用患牙咬东西，一周以后复诊。
对牙神经已死但不痛的牙，考虑其在手术过程中可能激惹剧痛和肿胀，第一次最好不要动神经，封消炎消毒的药，一周后复诊，这叫预防性封药。
对牙神经已死但仍痛的牙，轻者可预防性封药，重者需开放引流，让脓血性分泌物流出，以减轻根部的压力，并嘱病人回去服用抗菌素。不痛时来做根管治疗。
第二次
拆掉封药，用器械去除神经，需要在根管里插针拍第2张X光片以测量根管的准确长度，继续扩大和清理根管（这叫根管预备，是最重要的手术环节，使用登士柏Protaper根管预备系统，可大大降低手术复杂复杂程度，缩短治疗时间，达到精美根扩效果），降低咬合，然后封消毒药，嘱病人一周后复诊。
第三次
拆掉封药，用牙胶尖加根管药物充填根管，（目前国际公认的疗效最好的是组合热塑牙胶充填技术，经临床验证，热注牙胶根充封闭性优于一般根充法，根充后可形成一个均质致密的整体，空间稳定性好，与糊剂联用更可封闭根管壁与牙胶间的不规则微隙）。手术后需要拍第3张片子，以评估根管充填的长度和致密度是否到位，是否符合标准。如果不是客观原因而是由于医生的操作不当所导致的根管充填的长度和致密度不成功，则必须重做根管治疗。
提醒
如果是前磨牙或磨牙，嘱病人半个月后最好做牙套以保护牙齿免得咬裂、咬碎。
保存好所有的牙片，嘱病人半年、一年、2~3年作定期复查，以对比观察牙病是否愈合或无变化或牙根周围病变扩大。需要提醒病人注意的是：手术成功与病变愈合是两个不同的概念，前者表示在手术过程中没有遇到主、客观原因使手术不能按原方案进行导致手术失败而要拔牙；病变愈合则是原来根尖周围的炎症范围逐渐缩小直到消失，牙齿的功能基本恢复，这需要一个较长的时间。一般需要1~2年，有的则需要更长的时间。
（提醒：具体流程还是医生根据牙齿具体情况而定）
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